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由于信息和錯誤信息在現代媒體生態系統中的傳播速度,事實核查變得越來越重要。因此,研究人員一直在探索如何實現事實核查的自動化,使用基于自然語言處理、機器學習、知識表示和數據庫的技術來自動預測聲明的準確性。在本文中,我們對自然語言處理產生的自動事實檢查進行了綜述,并討論了它與相關任務和學科的聯系。在這個過程中,我們概述了現有的數據集和模型,旨在統一各種定義,并確定共同的概念。最后,我們強調了未來研究的挑戰。

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事實核查是評估書面或口頭聲明是否屬實的任務。這是新聞業的一項基本任務,通常由PolitiFact等專門組織手工完成。報紙、雜志、書籍的出版商在出版前,除了進行外部事實核查外,還進行內部事實核查,以促進報道的真實性。圖1顯示了來自PolitiFact的一個示例,以及證據(總結)和結論。

事實核查是一項耗時的任務。為了評估圖1中的說法,記者需要搜索潛在的許多來源,以找到在特朗普和奧巴馬執政期間的就業增長情況,評估每個來源的可靠性,并進行比較。這個過程可能需要專業的事實核查員幾個小時或幾天(Hassan et al., 2015;Adair等人,2017)。更糟糕的是,事實核查員經常在嚴格和緊迫的期限下工作,特別是在內部流程的情況下(Borel, 2016;戈德勒和賴克,2017),一些研究表明,在所有發表的文章中,只有不到一半的文章經過了驗證(Lewis et al., 2008)。考慮到出現的新信息的數量和傳播速度,手工驗證是不夠的。

自動化事實核查過程已經在計算新聞的背景下進行了討論(Flew et al., 2010; Cohen et al., 2011; Graves, 2018),并在人工智能領域得到了極大的關注。Vlachos和Riedel(2014)提出將其構建為一個組件序列——識別需要檢查的聲明,找到合適的證據,得出結論——可以建模為自然語言處理(NLP)任務。這推動了自動化管道的開發,這些自動化管道由子任務組成,可以映射到NLP社區中充分探索的任務。數據集的發展使進展成為可能,這些數據集包括從事實核查網站收集的聲明,如Liar(王,2017),或專門為研究而設計的聲明,如FEVER(Thorne et al., 2018a)。

越來越多的研究機構正在探索事實核查自動化所必需的各種任務和子任務,并滿足應對新出現挑戰的新方法的需要。早期的發展在Thorne和Vlachos(2018)進行了調研,這仍然是最接近該主題的詳盡概述。然而,他們提出的框架不包括確定哪些聲明要求需要驗證的工作(即聲明檢測)的幾篇論文調研了這項任務的各個組成部分。ZZubiaga et al. (2018) 和 Islam et al. (2020)關注識別謠言在社交媒體上,Kucuk(2020)和Hardalov et al。(2021)檢測的立場對聲明證據,Kotonya和托尼(2020)為factchecks生產解釋和理由。雖然這些調研對了解事實核查技術的各個方面非常有用,但它們是碎片化的,并集中于具體的子任務和組件;我們的目標是提供一個全面和詳盡的主題作為一個整體。

一些論文對相關課題進行了調查。Lazer et al. (2018) 和 Zhou 和 Zafarani (2020) 調研了假新聞方面的工作,包括對這個問題的描述性工作,以及試圖通過計算手段打擊假新聞的工作。Oshikawa等人(2020)也對用于假新聞檢測的NLP方法進行了全面綜述。然而,假新聞檢測與事實核查的范圍不同,前者側重于評估新聞文章,包括基于與真實性無關的方面的標簽項目,如諷刺檢測(Oshikawa et al., 2020; Zhou 和 Zafarani, 2020)。此外,還經常考慮其他因素,如索賠要求所觸及的受眾,以及索賠要求的意圖和形式。Da San Martino等人(2020b)最近進行的一項調研顯示,這些因素在宣傳檢測中也很重要。與這些努力不同,本綜述中討論的工作集中于評估一般領域聲明的準確性。最后,Shu et al.(2017)和da Silva et al.(2019)以社交媒體數據為重點,對假新聞檢測和事實核查的研究進行了調研,而這項調研涵蓋了跨領域和來源的事實核查,包括新聞通訊社、科學等。

在這個綜述中,我們提出了一個全面和最新的調研自動化事實核查,統一了各種組成部分和定義,在以前的研究發展成一個共同的框架。首先,我們定義了事實核查框架的三個階段——聲明檢測、證據檢索和聲明驗證,后者包括判決預測和理由生成。然后,我們給出現有數據集和建模策略的概述,根據我們的框架對它們進行分類和上下文化。最后,我們討論了已經解決的關鍵研究挑戰,并給出了我們認為未來研究應該解決的挑戰的方向。我們伴隨調研而來的是一個資料庫,它提供資源和研究進展的及時更新。

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相關內容

機器學習(ML)最近的快速進展提出了一些科學問題,挑戰了該領域長期存在的教條。最重要的謎題之一是過度參數化模型的良好經驗泛化。過度參數化的模型對于訓練數據集的大小來說過于復雜,這導致它們完美地擬合(即插值)訓練數據,而訓練數據通常是有噪聲的。這種對噪聲數據的插值傳統上與有害的過擬合有關,但最近觀察到,從簡單的線性模型到深度神經網絡的各種插值模型在新測試數據上都能很好地泛化。事實上,最近發現的雙下降現象表明,在測試性能上,高度過度參數化的模型往往比最好的欠參數化模型更好。理解這種過度參數化的學習需要新的理論和基礎的實證研究,即使是最簡單的線性模型。這種理解的基礎已經在最近對過度參數化線性回歸和相關統計學習任務的分析中奠定,這導致了雙下降的精確分析特征。本文簡要概述了這一新興的過度參數化ML理論(以下簡稱為TOPML),并從統計信號處理的角度解釋了這些最新發現。我們強調將TOPML研究領域定義為現代ML理論的一個子領域的獨特方面,并概述了仍然存在的有趣的未決問題。

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引言

深度學習技術已經徹底改變了許多工程和科學問題的解決方式,使數據驅動方法成為實踐成功的主要選擇。當前的深度學習方法是經典機器學習(ML)設置的極限開發版本,以前這些設置受到有限的計算資源和訓練數據可用性不足的限制。目前已建立的實踐是從一組訓練示例中學習高度復雜的深度神經網絡(DNN),這些示例雖然本身很大,但相對于DNN中的參數數量來說相當小。雖然這種過度參數化的DNN在ML實踐中是最先進的,但這種實際成功的根本原因仍不清楚。特別神秘的是兩個經驗觀察結果: 1) 模型中添加更多參數的明顯益處(在泛化方面),2) 這些模型即使完美地擬合了噪聲訓練數據,也能很好地泛化。這些觀察結果在現代ML的不同結構中都得到了體現——當它們首次被用于復雜的、最先進的DNN時(Neyshabur et al., 2014; Zhang et al., 2017)),它們已經在更簡單的模型家族中出土,包括寬神經網絡、核方法,甚至線性模型(Belkin et al., 2018b; Spigler et al., 2019; Geiger et al., 2020; Belkin et al., 2019a)。

在本文中,我們綜述了最近發展起來的過度參數化機器學習理論(簡稱TOPML),該理論建立了與訓練數據插值(即完美擬合)相關的現象相關的基本數學原理。我們很快將提供一個過度參數化ML的正式定義,但在這里描述一些模型必須滿足的顯著屬性,以合格為過度參數化。首先,這樣的模型必須是高度復雜的,因為它的獨立可調參數的數量要遠遠高于訓練數據集中的示例數量。其次,這樣的模型絕不能以任何方式被明確地規范化。DNN是過度參數化模型的常見實例,這些模型通常沒有明確的正則化訓練(參見,例如,Neyshabur et al., 2014; Zhang et al., 2017)。這種過度參數化和缺乏顯式正則化的組合產生了一個可插值訓練示例的學習模型,因此在任何訓練數據集上都實現了零訓練誤差。訓練數據通常被認為是來自底層數據類(即噪聲數據模型)的噪聲實現。因此,插值模型完美地擬合了基礎數據和訓練示例中的噪聲。傳統的統計學習總是將噪聲的完美擬合與較差的泛化性能聯系在一起(例如,Friedman et al., 2001, p. 194);因此,值得注意的是,這些插值解決方案通常能很好地泛化到訓練數據集以外的新測試數據。

在本文中,我們回顧了TOPML研究的新興領域,主要關注在過去幾年發展的基本原理。與最近的其他綜述相比(Bartlett et al., 2021; Belkin, 2021),我們從更基本的信號處理角度來闡明這些原則。形式上,我們將TOPML研究領域定義為ML理論的子領域,其中1. 明確考慮訓練數據的精確或近似插值 2. 相對于訓練數據集的大小,學習模型的復雜性較高。

本文組織如下。在第2節中,我們介紹了過度參數化學習中插值解的基礎知識,作為一個機器學習領域,它超出了經典偏方差權衡的范圍。在第3節中,我們概述了最近關于過度參數化回歸的結果。在這里,我們從信號處理的角度直觀地解釋了過度參數化學習的基本原理。在第4節中,我們回顧了關于過度參數化分類的最新發現。在第5節中,我們概述了最近關于過度參數化子空間學習的工作。在第6節中,我們考察了最近關于回歸和分類以外的過度參數化學習問題的研究。在第7節中,我們討論了過度參數化ML理論中的主要開放問題。

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摘要

深度學習(Deep Learning, DL)是當前計算機視覺領域應用最廣泛的工具。它精確解決復雜問題的能力被用于視覺研究,以學習各種任務的深度神經模型,包括安全關鍵應用。然而,現在我們知道,DL很容易受到對抗性攻擊,這些攻擊可以通過在圖像和視頻中引入視覺上難以察覺的擾動來操縱它的預測。自2013年~[1]發現這一現象以來,引起了機器智能多個子領域研究人員的極大關注。在[2]中,我們回顧了計算機視覺社區在深度學習的對抗性攻擊(及其防御)方面所做的貢獻,直到2018年到來。這些貢獻中有許多啟發了這一領域的新方向,自見證了第一代方法以來,這一領域已顯著成熟。因此,作為[2]的后續成果,本文獻綜述主要關注自2018年以來該領域的進展。為了確保文章的真實性,我們主要考慮計算機視覺和機器學習研究的權威文獻。除了全面的文獻綜述外,本文還為非專家提供了該領域技術術語的簡明定義。最后,本文在文獻綜述和[2]的基礎上,討論了該方向面臨的挑戰和未來的展望。

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引言

深度學習(DL)[3]是一種數據驅動技術,可以在大數據集上精確建模復雜的數學函數。它最近為科學家在機器智能應用方面提供了許多突破。從DNA[4]的突變分析到腦回路[5]的重建和細胞數據[6]的探索; 目前,深度學習方法正在推進我們對許多前沿科學問題的知識。因此,機器智能的多個當代子領域迅速采用這種技術作為“工具”來解決長期存在的問題也就不足為奇了。隨著語音識別[7]和自然語言處理[8],計算機視覺是目前嚴重依賴深度學習的子領域之一。

計算機視覺中深度學習的興起是由Krizhevsky等人在2012年的開創性工作觸發的,他們報告了使用卷積神經網絡(CNN)[11]在硬圖像識別任務[10]上的記錄性能改善。自[9]以來,計算機視覺社區對深度學習研究做出了重大貢獻,這導致了越來越強大的神經網絡[12]、[13]、[14],可以在其架構中處理大量層——建立了“深度”學習的本質。計算機視覺領域的進步也使深度學習能夠解決人工智能(AI)的復雜問題。例如,現代人工智能的一個最高成就,即tabula-rasa learning[15],很大程度上要歸功于源于計算機視覺領域的殘差學習[12]。

由于深度學習[15]的(明顯)超人類能力,基于計算機視覺的人工智能被認為已經達到部署在安全和安保關鍵系統所需的成熟度。汽車自動駕駛[18],ATM的面部識別[19]和移動設備的面部識別技術[20]都是一些早期的真實世界的例子,描繪了現代社會對計算機視覺解決方案的發展信念。隨著高度活躍的基于深度學習的視覺研究,自動駕駛汽車[21],人臉識別[22],[23],機器人[24]和監控系統[25]等,我們可以預見,深度學習在關鍵安全計算機視覺應用中的無處不在。然而,由于深度學習[1]的對抗漏洞的意外發現,人們對這種前景產生了嚴重的擔憂。

Szegedy等人[1]發現,深度神經網絡預測可以在極低量級輸入擾動下被操縱。對于圖像而言,這些擾動可以限制在人類視覺系統的不可感知范圍內,但它們可以完全改變深度視覺模型的輸出預測(見圖1)。最初,這些操縱信號是在圖像分類任務[1]中發現的。然而,它們的存在現在已被公認為各種主流計算機視覺問題,如語義分割[27],[28];目標檢測[29],[30];目標跟蹤[31],[32]。文獻強調了對抗式干擾的許多特征,這使它們對作為實用技術的深度學習構成了真正的威脅。例如,可以反復觀察到,受攻擊的模型通常對操縱圖像[2],[17]的錯誤預測具有很高的置信度。同樣的微擾常常可以欺騙多個模型[33],[34]。文獻也見證了預先計算的擾動,稱為普遍擾動,可以添加到“任何”圖像,以高概率[35],[36]欺騙給定模型。這些事實對關鍵安全應用有著深遠的影響,特別是當人們普遍認為深度學習解決方案具有超越人類能力[15],[37]的預測能力時。

由于其重要性,對抗性攻擊(及其防御)的話題在過去五年中受到了研究團體的相當大的關注。在[2]中,我們調研了這個方向的貢獻,直到2018年到來。這些工作中的大多數可以被視為第一代技術,探索核心算法和技術,以欺騙深度學習或防御它的對抗性攻擊。其中一些算法激發了后續方法的靈感,進一步改進和適應核心攻擊和防御技術。這些第二代方法也被發現更多地關注其他視覺任務,而不僅僅是分類問題,這是這一方向早期貢獻的主要興趣主題。

自2018年以來,該研究方向的論文發表數量不斷增加(見圖2-a,b)。當然,這些出版物也包括文獻綜述的實例,如[38],[39],[40],[41],[42]。我們在這里提供的文獻綜述在許多方面不同于現有的綜述。這篇文章的獨特之處在于它是2的繼承。隨后的調研,如[41],通常緊跟[2];或者針對特定問題在[2]上建立[42]。近年來,這一方向在計算機視覺領域已經顯著成熟。通過構建[2]和后續文獻的見解,我們能夠為這一快速發展的研究方向提供更精確的技術術語定義。這也導致了本文所回顧的文獻的更連貫的結構,為此我們提供了基于研究團體當前對術語的理解的簡明討論。此外,我們關注出現在著名的計算機視覺和機器學習研究出版刊物的論文。專注于領先的貢獻使我們能夠為計算機視覺和機器學習研究人員提供一個更清晰的方向展望。更不用說,本文回顧了這個快速發展領域的最新貢獻,以提供迄今為止在這個方向上最全面的回顧。

本文的其余部分組織如下。在第二節中,我們提供了本文其余部分中使用的技術術語的定義。在第三節中,我們闡述了對抗性攻擊這一更廣泛的問題。第一代攻擊將在第四節中討論,接下來是第五節中關注分類問題的最近的攻擊。我們在第六節中關注分類問題之外的最近的攻擊,在第七節中關注針對物理世界的量身定制的攻擊。更多側重于存在對抗性例子的理論方面的貢獻將在第九節中討論。最近的防御方法是第十部分的主題。文章對第十一部分的文獻趨勢進行了反思,并對這一研究方向的前景和未來方向進行了討論。最后,我們在第十二節結束。

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社區揭示了不同于網絡中其他社區成員的特征和聯系。社區檢測在網絡分析中具有重要意義。除了經典的譜聚類和統計推理方法,我們注意到近年來用于社區檢測的深度學習技術在處理高維網絡數據方面的優勢有了顯著的發展。因此,通過深度學習對社區檢測的最新進展進行全面概述,對學者和從業者都是及時的。本文設計并提出了一種新的分類方法,包括基于深度神經網絡的深度學習模型、深度非負矩陣分解和深度稀疏濾波。主要的類別,即深度神經網絡,進一步分為卷積網絡,圖注意力網絡,生成對抗網絡和自動編碼器。綜述還總結了流行的基準數據集、模型評估指標和開源實現,以解決實驗設置。然后討論了社區檢測在各個領域的實際應用,并提出了實現方案。最后,通過提出這一快速發展的深度學習領域中具有挑戰性的課題,我們概述了未來的發展方向。

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引言

早在20世紀20年代,社會學和社會人類學就對社區進行了研究。然而,直到21世紀之后,研究人員才開始利用強大的數學工具和大規模數據操作來檢測社區,以解決具有挑戰性的問題[2]。自2002年[3]以來,Girvan和Newman將圖劃分問題引起了更廣泛的關注。在過去的10年里,計算機科學研究者廣泛研究了基于網絡拓撲結構[5]-[8]和實體語義信息[9]-[11]、靜態網絡[12]-[14]、小型網絡和大型網絡[15]-[17]的社區檢測問題[4]。越來越多的基于圖的方法被開發出來用于檢測具有復雜數據結構[18],[19]環境中的社區。通過社區檢測,可以詳細分析網絡中社區的動態和影響,如謠言傳播、病毒爆發、腫瘤進化等。

社區的存在推動了社區檢測研究的發展,是一個越來越具有現實意義的研究領域。俗話說,物以類聚,人以群分。根據六度分離理論,世界上任何一個人都可以通過六個熟人認識其他人[21]。事實上,我們的世界是一個由一系列社區組成的巨大網絡。例如,通過檢測社交網絡[22]-[24]中的社區,如圖1所示,平臺贊助商可以向目標用戶推廣他們的產品。在引文網絡[25]中,社區檢測決定了研究主題的重要性、關聯性、演化和識別研究趨勢。在代謝網絡[26]、[27]和蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)網絡[28]中,社區檢測揭示了具有相似生物學功能的代謝和蛋白質。同樣,腦網絡[19]、[29]中的社區檢測反映了腦區域的功能和解剖分離。

許多傳統的技術,如譜聚類[30],[31]和統計推理[32]-[35],被用于小型網絡和簡單的場景。然而,由于它們的計算和空間成本巨大,它們無法擴展到大型網絡或具有高維特征的網絡。現實網絡中非線性結構信息豐富,使得傳統模型在實際應用中不太適用。因此,需要更強大的具有良好計算性能的技術。目前,深度學習提供了最靈活的解決方案,因為深度學習模型: (1) 學習非線性網絡屬性,如節點之間的關系,(2) 提供一個低維的網絡表示,保持復雜的網絡結構,(3) 提高了從各種信息中檢測社區的性能。因此,深度學習用于社區檢測是一種新的趨勢,需要及時全面的調查。

據我們所知,本文是第一次全面調研深度學習在社區檢測方面的貢獻。以往的研究主要集中在傳統的社區檢測上,回顧了其在發現網絡固有模式和功能[36]、[37]方面的重要影響。這篇論文綜述了一些具體的技術,但不限于: 基于隨機塊模型(sms)的部分檢測[38],標簽傳播算法(LPAs)[39],[40],以及單目標和多目標優化的進化計算[13],[14]。在網絡類型方面,研究人員綜述了動態網絡[12]、有向網絡[41]和多層網絡[5]中的社區檢測方法。此外,[6],[7]還回顧了一系列關于不相交和重疊的社區缺陷的概述。圍繞應用場景,以往的論文綜述了社交網絡[9]、[42]中的社區檢測技術。

本文旨在幫助研究人員和從業者從以下幾個方面了解社區檢測領域的過去、現在和未來趨勢:

  • 系統性分類和綜合評價。我們為此項綜述提出了一個新的系統分類(見圖3)。對于每個類別,我們回顧、總結和比較代表性的工作。我們還簡要介紹了現實世界中的社區檢測應用。這些場景為未來的社區檢測研究和實踐提供了見解。

  • 豐富的資源和高影響力的參考資料。該綜述不僅是文獻綜述,而且是基準數據集、評估指標、開源實現和實際應用的資源集合。我們在最新的高影響力國際會議和高質量同行評審期刊上廣泛調查社區檢測出版物,涵蓋人工智能、機器學習、數據挖掘和數據發現等領域。

  • 未來的發展方向。由于深度學習是一個新的研究趨勢,我們討論了當前的局限性,關鍵的挑戰和開放的問題,為未來的方向。

社區檢測在網絡分析和數據挖掘中具有重要意義。圖4展示了傳統學習方法和深度學習方法的發展。傳統的方法是在網絡結構上探索社區。這七種方法(圖3左圖)僅以一種簡單的方式捕捉淺連接。傳統方法的檢測結果往往是次優的。我們將在本節簡要回顧它們的代表性方法。深度學習方法(圖3右圖)揭示了深度網絡信息,復雜關系,處理高維數據。

本文提出了一種深度社區檢測的分類方法。分類法將方法歸納為六類: 卷積網絡、圖注意力網絡(GAT)、生成對抗網絡(GAN)、自動編碼器(AE)、深度非負矩陣分解(DNMF)和基于深度稀疏濾波(DSF)的深度社區檢測方法。卷積網絡包括卷積神經網絡(CNN)和圖卷積網絡(GCN)。AE又分為堆疊型AE、稀疏型AE、去噪型AE、圖卷積型AE、圖關注型AE和變分型AE (VAE)。

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圖機器學習(GML)因其建模生物分子結構、它們之間的功能關系以及整合多組數據集的能力而受到制藥和生物技術行業越來越多的關注。在此,我們提出了一個關于藥物發現和研發多學科的學術-工業綜述的主題。在介紹了關鍵術語和建模方法之后,我們按時間順序介紹了藥物開發流程,以確定和總結工作包括: 靶標識別、小分子和生物制劑的設計,以及藥物的重新利用。盡管該領域仍處于新興階段,但關鍵的里程碑,包括重新用途的藥物進入體內研究,表明GML將成為生物醫學機器學習的建模框架選擇。

引言

從藥物發現到上市,平均超過10億美元,可能持續12年或更長時間[1 - 3]; 由于高流失率,很少有人能在10年內進入市場[4,5]。整個過程的高損耗不僅使投資不確定,而且需要市場批準的藥物為早期的失敗買單。盡管在過去十多年里,整個行業都在關注效率問題,同時也受到了一些出版物和年度報告的推動,這些報告強調了終結排他性和生產率下降會導致收入下降,但事實證明,在科學、技術和監管變革的背景下,明顯的改善是難以實現的。由于上述原因,現在人們對運用計算方法來加快藥物發現和研發管道[6]的各個部分更感興趣,見圖1。

數字技術已經改變了產生大量數據的藥物研發過程。變化范圍從電子實驗室筆記本[7],電子法規提交,通過增加實驗室、實驗和臨床試驗數據收集[8],包括設備的使用[9,10],到精準醫療和“大數據”[11]的使用。收集到的關于治療的數據遠遠超出了研發范圍,包括醫院、專家和初級保健醫療專業人員的患者記錄——包括從社交媒體上獲取的觀察數據,例如藥物警戒數據[12,13]。通過可重復使用藥物的數據庫,有無數的在線數據庫和其他信息來源,包括科學文獻、臨床試驗信息[14,15]。技術的進步現在允許更大的組學分析,而不僅僅是基因分型和全基因組測序(WGS);微流體技術和抗體標記的標準化使得單細胞技術廣泛應用于轉錄組的研究,例如使用RNA-seq[16],蛋白質組(靶向),例如通過大量細胞檢測[17],甚至多種方式結合[18]。

在藥物發現過程中產生和使用的生物醫學數據的關鍵特征之一是其相互關聯的性質。這種數據結構可以用圖表示,這是一種數學抽象,在生物學的各個學科和領域中廣泛使用,以模擬在不同尺度上進行干預的生物實體之間的各種相互作用。在分子尺度上,蛋白質和其他生物分子的氨基酸殘基[19,20]和小分子藥物的組成原子和化學鍵結構[21,22]可以用圖表示。在中間尺度上,相互作用組是捕獲生物分子物種(如代謝物、mRNA、蛋白質)[23]之間特定類型相互作用的圖,其中蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)圖可能是最常見的。最后,在更高的抽象層次上,知識圖譜可以表示電子病歷(EMR)中藥物、副作用、診斷、相關治療和檢測結果之間的復雜關系[24,25]。

在過去的十年里,兩個新興趨勢重塑了數據建模社區: 網絡分析和深度學習。“網絡醫學”范式早已在生物醫學領域[26]得到認可,借用了圖論和復雜網絡科學的多種方法,運用于生物圖,如PPIs和基因調控網絡(GRNs)。這一領域的大多數方法都局限于手工繪制的圖特征,如中心性度量和聚類。相比之下,深度神經網絡是一種特殊的機器學習算法,用于學習最優的特定任務特征。深度學習的影響在計算機視覺[27]和自然語言處理[28]方面具有開創性,但受限于對數據結構規律性的要求,局限于特定領域。在這兩個領域的收斂處是圖機器學習(GML),這是一類利用圖和其他不規則數據集(點云、網格、流形等)的結構的新ML方法。

GML方法的基本思想是學習節點29,30、邊(如預測推薦系統中的未來交互)或整個圖31的有效特征表示。特別是,圖神經網絡(GNN)[32-34],它是專為圖結構數據設計的深度神經網絡體系結構,正引起越來越多的興趣。GNN通過傳播鄰近節點的信息來迭代更新圖中節點的特征。這些方法已經成功地應用于各種任務和領域,如社交媒體和電子商務中的推薦[35-38],谷歌地圖[39]中的流量估計,社交媒體[40]中的錯誤信息檢測,以及自然科學的各個領域,包括建模流體,硬質固體,以及可變形材料相互作用[41]和粒子物理學中的事件分類[44,43]。

在生物醫學領域,GML在挖掘圖結構數據(包括藥物-靶標相互作用和通過知識圖譜嵌入進行關系預測)方面已經達到了最新水平[30,44,45];分子特性預測[21,22],包括預測吸收、分布、代謝和排泄(ADME)譜[46];靶標識別[47]到重新設計分子的早期工作[48,49]。最值得注意的是,Stokes等人利用定向信息傳遞的GNN作用于分子結構,為抗生素研發提出了可重用的候選抗生素,驗證了他們在體內的預測,從而提出了結構明顯不同于已知抗生素的合適的可重用候選抗生素。因此,GML方法在藥物開發過程中具有極大的應用前景。

結論:

  • 歷史上,生物分子相互作用和基因調控網絡的分析一直具有巨大的學術興趣,但在藥物發現和開發中可翻譯的結果有限。

  • 網絡醫學使用手工繪制的圖特征提供了很有前景的結果,但在整合不同的生物數據源的問題上缺乏任何有原則的解決方案: 結構數據(藥物和生物分子)、功能關系(抑制、激活等)和表達(RNA-seq、蛋白質組學等)。

  • 深度學習目前已應用于生物醫學研究的多個領域,特別是在生物醫學圖像(如組織病理標本)的解釋方面,實現由上級到醫生的結果。

  • 圖機器學習將網絡拓撲分析技術與深度學習技術相結合,學習有效的節點特征表示。

  • 圖機器學習已被應用于藥物發現和開發中的問題,并取得了巨大的成功,出現了一些實驗結果: 小分子設計、藥物與靶標相互作用的預測、藥物與藥物相互作用的預測和藥物的重新利用都是比簡單的非圖ML方法取得了相當大的成功和改進的任務。

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圖是連接數據網絡結構的一種常用表示形式。圖數據可以在廣泛的應用領域中找到,如社會系統、生態系統、生物網絡、知識圖譜和信息系統。隨著人工智能技術的不斷滲透發展,圖學習(即對圖進行機器學習)越來越受到研究者和實踐者的關注。圖學習對許多任務都非常有效,如分類,鏈接預測和匹配。圖學習方法通常是利用機器學習算法提取圖的相關特征。在這個綜述中,我們提出了一個關于圖學習最全面的概述。特別關注四類現有的圖學習方法,包括圖信號處理、矩陣分解、隨機游走和深度學習。分別回顧了這些類別下的主要模型和算法。我們研究了諸如文本、圖像、科學、知識圖譜和組合優化等領域的圖學習應用。此外,我們還討論了該領域幾個有前景的研究方向。

真實的智能系統通常依賴于機器學習算法處理各種類型的數據。盡管圖數據無處不在,但由于其固有的復雜性,給機器學習帶來了前所未有的挑戰。與文本、音頻和圖像不同,圖數據嵌入在一個不規則的領域,使得現有機器學習算法的一些基本操作不適用。許多圖學習模型和算法已經被開發出來解決這些挑戰。本文系統地綜述了目前最先進的圖學習方法及其潛在的應用。這篇論文有多種用途。首先,它作為不同領域(如社會計算、信息檢索、計算機視覺、生物信息學、經濟學和電子商務)的研究人員和從業者提供圖學習的快速參考。其次,它提供了對該領域的開放研究領域的見解。第三,它的目的是激發新的研究思路和更多的興趣在圖學習。

圖,又稱網絡,可以從現實世界中豐富的實體之間的各種關系中提取。一些常見的圖表已經被廣泛用于表達不同的關系,如社會網絡、生物網絡、專利網絡、交通網絡、引文網絡和通信網絡[1]-[3]。圖通常由兩個集合定義,即頂點集和邊集。頂點表示圖形中的實體,而邊表示這些實體之間的關系。由于圖學習在數據挖掘、知識發現等領域的廣泛應用,引起了人們的廣泛關注。由于圖利用了頂點[4],[5]之間的本質和相關關系,在捕獲復雜關系方面,圖學習方法變得越來越流行。例如,在微博網絡中,通過檢測信息級聯,可以跟蹤謠言的傳播軌跡。在生物網絡中,通過推測蛋白質的相互作用可以發現治療疑難疾病的新方法。在交通網絡中,通過分析不同時間戳[6]的共現現象,可以預測人類的移動模式。對這些網絡的有效分析很大程度上取決于網絡的表示方式。

一般來說,圖學習是指對圖進行機器學習。圖學習方法將圖的特征映射到嵌入空間中具有相同維數的特征向量。圖學習模型或算法直接將圖數據轉換為圖學習體系結構的輸出,而不將圖投影到低維空間。由于深度學習技術可以將圖數據編碼并表示為向量,所以大多數圖學習方法都是基于或從深度學習技術推廣而來的。圖學習的輸出向量在連續空間中。圖學習的目標是提取圖的期望特征。因此,圖的表示可以很容易地用于下游任務,如節點分類和鏈接預測,而無需顯式的嵌入過程。因此,圖學習是一種更強大、更有意義的圖分析技術。

在這篇綜述論文中,我們試圖以全面的方式檢驗圖機器學習方法。如圖1所示,我們關注現有以下四類方法:基于圖信號處理(GSP)的方法、基于矩陣分解的方法、基于隨機游走的方法和基于深度學習的方法。大致來說,GSP處理圖的采樣和恢復,并從數據中學習拓撲結構。矩陣分解可分為圖拉普拉斯矩陣分解和頂點接近矩陣分解。基于隨機游動的方法包括基于結構的隨機游動、基于結構和節點信息的隨機游動、異構網絡中的隨機游動和時變網絡中的隨機游動。基于深度學習的方法包括圖卷積網絡、圖注意力網絡、圖自編碼器、圖生成網絡和圖時空網絡。基本上,這些方法/技術的模型架構是不同的。本文對目前最先進的圖學習技術進行了廣泛的回顧。

傳統上,研究人員采用鄰接矩陣來表示一個圖,它只能捕捉相鄰兩個頂點之間的關系。然而,許多復雜和不規則的結構不能被這種簡單的表示捕獲。當我們分析大規模網絡時,傳統的方法在計算上是昂貴的,并且很難在現實應用中實現。因此,有效地表示這些網絡是解決[4]的首要問題。近年來提出的網絡表示學習(NRL)可以學習低維表示[7]-[9]的網絡頂點潛在特征。當新的表示被學習后,可以使用以前的機器學習方法來分析圖數據,并發現數據中隱藏的關系。

當復雜網絡被嵌入到一個潛在的、低維的空間中時,結構信息和頂點屬性可以被保留[4]。因此,網絡的頂點可以用低維向量表示。在以往的機器學習方法中,這些向量可以看作是輸入的特征。圖學習方法為新的表示空間中的圖分析鋪平了道路,許多圖分析任務,如鏈接預測、推薦和分類,都可以有效地解決[10],[11]。網絡的圖形化表現方式揭示了社會生活的各個方面,如交流模式、社區結構和信息擴散[12],[13]。根據頂點、邊和子圖的屬性,可以將圖學習任務分為基于頂點、基于邊和基于子圖三類。圖中頂點之間的關系可以用于分類、風險識別、聚類和社區檢測[14]。通過判斷圖中兩個頂點之間的邊的存在,我們可以進行推薦和知識推理。基于子圖[15]的分類,該圖可用于聚合物分類、三維可視化分類等。對于GSP,設計合適的圖形采樣方法以保持原始圖形的特征,從而有效地恢復原始圖形[16]具有重要意義。在存在不完整數據[17]的情況下,可以使用圖恢復方法構造原始圖。然后利用圖學習從圖數據中學習拓撲結構。綜上所述,利用圖學習可以解決傳統的圖分析方法[18]難以解決的以下挑戰。

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為機器配備對世界實體及其關系的全面了解一直是人工智能的一個長期目標。在過去的十年中,大規模知識庫(也稱為知識圖譜)已經從Web內容和文本源中自動構建出來,并且已經成為搜索引擎的關鍵模塊。這種機器知識可以被用來從語義上解釋新聞、社交媒體和網絡表格中的文本短語,并有助于回答問題、自然語言處理和數據分析。本文調查基本概念和實際的方法來創建和管理大型知識庫。它涵蓋了用于發現和規范化實體及其語義類型以及將它們組織成干凈的分類法的模型和方法。在此基礎上,本文討論了以實體為中心的屬性的自動提取。為了支持機器知識的長期生命周期和質量保證,本文提出了構建開放模式和知識管理的方法。學術項目的案例研究和工業知識圖表補充了概念和方法的調查。

概述

增強計算機的“機器知識”,可以推動智能應用是計算機科學的一個長期目標[323]。由于知識獲取方面取得了重大進展,這一以前難以捉摸的愿景如今已變得切實可行。這包括將嘈雜的互聯網內容轉化為實體和關系上的清晰知識結構的方法。知識獲取方法使得自動建設知識庫(KB):機器可讀的關于現實世界的事實的集合。如今,公開的KBs提供了數以百萬計的實體(比如人、組織、地點和書籍、音樂等創意作品)和數十億的聲明(比如誰研究了哪里,哪個國家擁有哪一種資本,或者哪位歌手演唱了哪首歌)。大公司部署的專有KBs包含了更大范圍的知識,有一到兩個數量級的實體。

知識庫成為關鍵資產的一個突出用例是Web搜索。當我們向百度、Bing或谷歌發送一個類似“迪倫抗議歌曲”的查詢時,我們會得到一個清晰的歌曲列表,比如《Blowin ' in the Wind》、《Masters of War》或《a- gonna Rain ' s a- gonna Fall》。因此,搜索引擎自動檢測到我們對某一個體實體的事實感興趣——這里是鮑勃·迪倫——并要求特定類型的相關實體——抗議歌曲——作為答案。這是可行的,因為搜索引擎在其后端數據中心有一個巨大的知識庫,有助于發現用戶請求(及其上下文)中的實體,并找到簡明的答案。

本文介紹了從Web和文本源自動構建和管理大型知識庫的方法。我們希望它將對博士生和對廣泛的主題感興趣的教師有用——從機器知識和數據質量到機器學習和數據科學,以及web內容挖掘和自然語言理解的應用。此外,本文還旨在為從事web、社會媒體或企業內容的語義技術的行業研究人員和實踐者提供幫助,包括從文本或半結構化數據構建意義的各種應用程序。不需要有自然語言處理或統計學習的先驗知識;我們將根據需要介紹相關的方法(或至少給出文獻的具體指示)。

這篇文章共分為十章。第2章給出了知識表示的基礎知識,并討論了知識庫的設計空間。第3、4和5章介紹了構建包含實體和類型的知識庫核心的方法。第3章討論了利用具有豐富和干凈的半結構化內容的優質資源,第4章討論了從文本內容中獲取的知識。第5章特別關注將實體規范化為唯一表示的重要問題。第6章和第7章通過發現和提取實體的屬性以及實體之間的關系的方法擴展了知識庫的范圍。第6章主要討論為感興趣的屬性預先設計模式的情況。第7章討論了為KB模式中尚未指定的屬性和關系發現新的屬性類型的情況。第8章討論了知識庫管理和知識庫長期維護的質量保證問題。第9章介紹了幾個具體KBs的案例研究,包括工業知識圖譜(KGs)。我們在第10章以關鍵課程和關于機器知識主題可能走向的展望來結束。

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深度學習算法已經在圖像分類方面取得了最先進的性能,甚至被用于安全關鍵應用,如生物識別系統和自動駕駛汽車。最近的研究表明,這些算法甚至可以超越人類的能力,很容易受到對抗性例子的攻擊。在計算機視覺中,與之相對的例子是惡意優化算法為欺騙分類器而產生的含有細微擾動的圖像。為了緩解這些漏洞,文獻中不斷提出了許多對策。然而,設計一種有效的防御機制已被證明是一項困難的任務,因為許多方法已經證明對自適應攻擊者無效。因此,這篇自包含的論文旨在為所有的讀者提供一篇關于圖像分類中對抗性機器學習的最新研究進展的綜述。本文介紹了新的對抗性攻擊和防御的分類方法,并討論了對抗性實例的存在性。此外,與現有的調查相比,它還提供了相關的指導,研究人員在設計和評估防御時應該考慮到這些指導。最后,在文獻綜述的基礎上,對未來的研究方向進行了展望。

//www.zhuanzhi.ai/paper/396e587564dc2922d222cd3ac7b84288

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當前的深度學習研究以基準評價為主。如果一種方法在專門的測試集上有良好的經驗表現,那么它就被認為是有利的。這種心態無縫地反映在持續學習的重現領域,在這里研究的是持續到達的基準數據集。核心挑戰是如何保護之前獲得的表示,以免由于迭代參數更新而出現災難性地遺忘的情況。然而,各個方法的比較是與現實應用程序隔離的,通常通過監視累積的測試集性能來判斷。封閉世界的假設仍然占主導地位。假設在部署過程中,一個模型保證會遇到來自與用于訓練的相同分布的數據。這帶來了一個巨大的挑戰,因為眾所周知,神經網絡會對未知的實例提供過于自信的錯誤預測,并在數據損壞的情況下崩潰。在這個工作我們認為值得注意的教訓來自開放數據集識別,識別的統計偏差以外的數據觀測數據集,和相鄰的主動學習領域,數據增量查詢等預期的性能收益最大化,這些常常在深度學習的時代被忽略。基于這些遺忘的教訓,我們提出了一個統一的觀點,以搭建持續學習,主動學習和開放集識別在深度神經網絡的橋梁。我們的結果表明,這不僅有利于每個個體范式,而且突出了在一個共同框架中的自然協同作用。我們從經驗上證明了在減輕災難性遺忘、主動學習中查詢數據、選擇任務順序等方面的改進,同時在以前提出的方法失敗的地方展示了強大的開放世界應用。

//www.zhuanzhi.ai/paper/e5bee7a1e93a93ef97e1c

概述:

隨著實用機器學習系統的不斷成熟,社區發現了對持續學習[1]、[2]的興趣。與廣泛練習的孤立學習不同,在孤立學習中,系統的算法訓練階段被限制在一個基于先前收集的i.i.d數據集的單一階段,持續學習需要利用隨著時間的推移而到來的數據的學習過程。盡管這種范式已經在許多機器學習系統中找到了各種應用,回顧一下最近關于終身機器學習[3]的書,深度學習的出現似乎已經將當前研究的焦點轉向了一種稱為“災難性推理”或“災難性遺忘”的現象[4],[5],正如最近的評論[6],[7],[8],[9]和對深度持續學習[8],[10],[11]的實證調查所表明的那樣。后者是機器學習模型的一個特殊效應,機器學習模型貪婪地根據給定的數據群更新參數,比如神經網絡迭代地更新其權值,使用隨機梯度估計。當包括導致數據分布發生任何變化的不斷到達的數據時,學習到的表示集被單向引導,以接近系統當前公開的數據實例上的任何任務的解決方案。自然的結果是取代以前學到的表征,導致突然忘記以前獲得的信息。

盡管目前的研究主要集中在通過專門機制的設計來緩解持續深度學習中的這種遺忘,但我們認為,一種非常不同形式的災難性遺忘的風險正在增長,即忘記從過去的文獻中吸取教訓的危險。盡管在連續的訓練中保留神經網絡表示的努力值得稱贊,但除了只捕獲災難性遺忘[12]的度量之外,我們還高度關注了實際的需求和權衡,例如包括內存占用、計算成本、數據存儲成本、任務序列長度和訓練迭代次數等。如果在部署[14]、[15]、[16]期間遇到看不見的未知數據或小故障,那么大多數當前系統會立即崩潰,這幾乎可以被視為誤導。封閉世界的假設似乎無所不在,即認為模型始終只會遇到與訓練過程中遇到的數據分布相同的數據,這在真實的開放世界中是非常不現實的,因為在開放世界中,數據可以根據不同的程度變化,而這些變化是不現實的,無法捕獲到訓練集中,或者用戶能夠幾乎任意地向系統輸入預測信息。盡管當神經網絡遇到不可見的、未知的數據實例時,不可避免地會產生完全沒有意義的預測,這是眾所周知的事實,已經被暴露了幾十年了,但是當前的努力是為了通過不斷學習來規避這一挑戰。選擇例外嘗試解決識別不可見的和未知的示例、拒絕荒謬的預測或將它們放在一邊供以后使用的任務,通常總結在開放集識別的傘下。然而,大多數現有的深度連續學習系統仍然是黑盒,不幸的是,對于未知數據的錯誤預測、數據集的異常值或常見的圖像損壞[16],這些系統并沒有表現出理想的魯棒性。

除了目前的基準測試實踐仍然局限于封閉的世界之外,另一個不幸的趨勢是對創建的持續學習數據集的本質缺乏理解。持續生成模型(如[17]的作者的工作,[18],[19],[20],[21],[22]),以及類增量持續學習的大部分工作(如[12]中給出的工作,[23],[24],[25],[26],[27],[28])一般調查sequentialized版本的經過時間考驗的視覺分類基準如MNIST [29], CIFAR[30]或ImageNet[31],單獨的類只是分成分離集和序列所示。為了在基準中保持可比性,關于任務排序的影響或任務之間重疊的影響的問題通常會被忽略。值得注意的是,從鄰近領域的主動機器學習(半監督學習的一種特殊形式)中吸取的經驗教訓,似乎并沒有整合到現代的連續學習實踐中。在主動學習中,目標是學會在讓系統自己查詢接下來要包含哪些數據的挑戰下,逐步地找到與任務解決方案最接近的方法。因此,它可以被視為緩解災難性遺忘的對抗劑。當前的持續學習忙于維護在每個步驟中獲得的信息,而不是無休止地積累所有的數據,而主動學習則關注于識別合適的數據以納入增量訓練系統的補充問題。盡管在主動學習方面的早期開創性工作已經迅速識別出了通過使用啟發式[32]、[33]、[34]所面臨的強大應用的挑戰和陷阱,但后者在深度學習[35]、[36]、[37]、[38]的時代再次占據主導地位,這些挑戰將再次面臨。

在這項工作中,我們第一次努力建立一個原則性和鞏固的深度持續學習、主動學習和在開放的世界中學習的觀點。我們首先單獨回顧每一個主題,然后繼續找出在現代深度學習中似乎較少受到關注的以前學到的教訓。我們將繼續爭論,這些看似獨立的主題不僅從另一個角度受益,而且應該結合起來看待。在這個意義上,我們建議將當前的持續學習實踐擴展到一個更廣泛的視角,將持續學習作為一個總括性術語,自然地包含并建立在先前的主動學習和開放集識別工作之上。本文的主要目的并不是引入新的技術或提倡一種特定的方法作為通用的解決方案,而是對最近提出的神經網絡[39]和[40]中基于變分貝葉斯推理的方法進行了改進和擴展,以說明一種走向全面框架的可能選擇。重要的是,它作為論證的基礎,努力闡明生成建模作為深度學習系統關鍵組成部分的必要性。我們強調了在這篇論文中發展的觀點的重要性,通過實證證明,概述了未來研究的含義和有前景的方向。

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知識圖譜補全是一類重要的問題。近年來基于圖神經網絡的知識圖譜表示得到了很多關注。這邊綜述論文總結了圖神經網絡知識圖譜補全的工作,值得查看!

摘要:知識圖譜在諸如回答問題和信息檢索等各種下游任務中越來越流行。然而,知識圖譜往往不完備,從而導致性能不佳。因此,人們對知識庫補全的任務很感興趣。最近,圖神經網絡被用來捕獲固有地存儲在這些知識圖譜中的結構信息,并被證明可以跨各種數據集實現SOTA性能。在這次綜述中,我們了解所提出的方法的各種優勢和弱點,并試圖在這一領域發現新的令人興奮的研究問題,需要進一步的調研。

知識庫是以關系三元組形式的事實信息的集合。每個關系三元組可以表示為(e1,r,e2),其中e1和e2是知識庫中的實體,r是e1和e2之間的關系。最受歡迎的知識庫表示方式是多關系圖,每個三元組(r e1, e2)是表示為有向邊從e1, e2與標簽r。知識圖譜被用于各種下游任務。

然而,由于知識庫是從文本中自動挖掘來填充的,它們通常是不完整的,因為不可能手動編寫所有事實,而且在提取過程中經常會出現不準確的情況。這種不準確性會導致各種下游任務的性能下降。因此,大量工作開發一種有效的工具來完成知識庫(KBs)方面,它可以在不需要額外知識的情況下自動添加新的事實。這個任務被稱為知識庫補全(或鏈接預測),其目標是解決諸如(e1,r,?)這樣的查詢。

第一種實現高效知識庫補全的方法是像TransE (Bordes et al.(2013))和TransH (Wang et al.(2014))這樣的加法模型,其中關系被解釋為隱藏實體表示的簡單翻譯。然后觀察到,諸如Distmult (Yang et al.(2015))和Complex (Trouillon et al.(2016))等乘法模型優于這些簡單的相加模型。與平移不同,旋轉(Sun等人(2019a))將關系定義為簡單的旋轉,這樣頭部實體就可以在復雜的嵌入空間中旋轉來匹配尾部實體,這已經被證明滿足了很多有用的語義屬性,比如關系的組合性。最近,引入了表達性更強的基于神經網絡的方法(如ConvE (Dettmers等人(2018))和ConvKB(Nguyen等人(2018)),其中評分函數與模型一起學習。然而,所有這些模型都獨立地處理每個三元組。因此,這些方法不能捕獲語義豐富的鄰域,從而產生低質量的嵌入。

圖已被廣泛用于可視化真實世界的數據。在將ML技術應用于圖像和文本方面已經取得了巨大進展,其中一些已成功應用于圖形(如Kipf和Welling(2017)、Hamilton等人(2017)、Velickovic等人(2018)。基于該方法的啟發,許多基于圖神經網絡的方法被提出用于KBC任務中獲取知識圖的鄰域。在這次調查中,我們的目的是研究這些工作。

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題目: Neural Machine Translation: A Review

簡介: 機器翻譯(MT)是將書面文本從一種自然語言自動翻譯成另一種自然語言,近年來,機器翻譯領域經歷了一次重大的范式轉變。統計機器翻譯主要依賴于各種基于計數的模型,在過去幾十年中一直主導機器翻譯的研究,但現在它已在很大程度上被神經機器翻譯(NMT)所取代。在這項工作中,我們將追溯現代NMT架構的起源到詞和句子嵌入和早期的例子的編碼器-解碼器網絡家族。最后,我們將對該領域的最新趨勢進行調查。

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